Recommandations relatives aux indications de l’utilisation des tests quadriplex (virus influenza A/B, RSV et SARS-CoV-2) et tests multiplex étendus pour le diagnostic des viroses respiratoires dans le contexte hospitalier et établissement de soins
MAJ – Version 1 _ 21/12/2023
Société Française de Microbiologie (SFM)
Agence National pour la Recherche sur le sida et les hépatites virales – Maladies infectieuses Emergentes (ANRS-MIE), réseau de virologie et pharmacologie médicale / groupe virus respiratoires
Dans le contexte de la circulation du SARS-CoV-2 parmi les autres virus respiratoires (le RSV et les virus influenza en particulier) et du fait de l’impossibilité de faire un diagnostic clinique ou radiologique étiologique (hors cluster), il est recommandé de détecter d’emblée au moins les 4 principaux virus respiratoires, c’est-à-dire le SARS-CoV-2, les virus influenza A et B et le RSV, à la fois chez l’enfant et l’adulte. Le Groupe de travail « virus respiratoires » du Réseau de virologie et pharmacologie médicale de l’ANRS-MIE et un représentant de la SFM se sont réunis afin de lister les indications du dépistage et du diagnostic des infections par les virus respiratoires en milieu hospitalier par utilisation des tests permettant le diagnostic simultané des virus influenza A et B, du RSV et du SARS-CoV-2 (test quadriplex), ainsi que pour recommander le positionnement de ces tests par rapport à un panel virus respiratoires plus étendu (tests multiplex). Pour mémoire, la composition des panels dépend des fournisseurs et peuvent comprendre, partiellement ou en totalité, en plus des principaux virus (virus influenza A et B, RSV et SARS-CoV-2), les métapneumovirus, les virus parainfluenza, les rhinovirus/entérovirus, les adénovirus, les coronavirus banals (HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-NL63 et HCoV-OC43). Certains panels peuvent détecter également des bactéries atypiques (tel que Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae et Bordetella pertussis) ou Legionella spp.
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Groupe d’experts :
ANRS Maladies Infectieuses Emergentes :
- Pr. Slim Fourati (Virologie, AP-HP Mondor),
- Pr. Marie-Anne Rameix-Welti (Virologie, AP-HP Ambroise Paré, CNR Virus respiratoires – Institut Pasteur, Paris)
- Dr Sylvie Pillet (Virologie, CHU Saint-Etienne)
- Pr Sylvie Rogez (Virologie, CHU Limoges)
- Dr Naël Zemali (Virologie, CHU Bordeaux)
- Dr Aurélie Schnuriger (Virologie, AP-HP Saint-Antoine – Tenon – Trousseau, Paris)
- Dr Ilka Engelmann (Virologie, CHU Montpellier)
- Dr Alexandre Gaymard (Virologie, CNR Virus respiratoires Hospices Civils de Lyon)
Société Française de Microbiologie (SFM) :
Pr Sonia Burrel (Virologie, CHU Bordeaux, Présidente SFM)
Groupe de relecture :
Section Virologie de la SFM
- Dr Céline Bressollette-Bodin (Virologie, CHU Nantes)
- Dr Maud Salmona (Virologie, AP-HP Saint-Louis, Paris)
Sociétés savantes partenaires :
- Société de Réanimation de Langue Française (SRLF)
Pr Laurent Papazian (Médecin Intensive et Réanimation, CH Bastia) - Société de Pathologie Infectieuse de Langue Française (SPILF)
Dr Bernard Castan (Maladies Infectieuses, CH Périgueux, Président de la SPILF) - Société Française de Médecine d’Urgence (SFMU)
Dr Donia BOUZID (Service Urgences, APHP Bichat Claude Bernard,) - Société Française d’Hygiène Hospitalière (SF2H)
Dr Sara Romano-Bertrand (Laboratoire d’Écologie Microbienne Hospitalière, CHU Montpellier) - Société Française d’Anesthésie et de Réanimation (SFAR)
Pr Marc Leone (Anesthésie et Réanimation, AP-HM, Marseille) - Société Française de Pédiatrie (SFP)
Pr Agnès Linglart (Pédiatrie, AP-HP Bicêtre, Présidente SFP)