Ingénieur H/F Centre National de Référence des Staphylocoques/ Institut des agents infectieux/ Centre de Biologie et Pathologie Nord/ Groupement Hospitalier Nord
Le profil idéal
- Niveau BAC +5
- Expérience en microbiologie exigée
- Expérience dans la mise en oeuvre et le maintien à niveau de pipelines d’analyses bio-informatiques
- Expérience dans les analyses épidémiologiques et phylogéographiques
- Expérience de l’utilisation des outils statistiques
- Maitrise d’un ou plusieurs langage(s) de programmation (Python ou R, Bash) et d’outil(s) gestionnaire(s) de flux (Nextflow)
- Maitrise des outils de données de séquençage de génome complet de bactéries (traitement des données brutes « short-reads » et « long-reads », annotation, typage MLST, détection de gènes de virulence et résistance, phylogénie)
- Connaissances pratiques et théoriques indispensables sur les staphylocoques
- Expérience de la norme ISO 15189
- Connaissance en biostatistiques
- Capacité à discuter avec différents professionnels (biologistes, TLBM, secrétaires, bio-informaticien, support technique fournisseurs)
- Connaissance de l’anglais technique et scientifique (niveau B2/C1) ; capacité de rédiger des articles scientifiques
- Connaissances des règles d’hygiène et de sécurité au travail
