• Niveau BAC +5
• Expérience en microbiologie exigée
• Expérience dans la mise en oeuvre et le maintien à niveau de pipelines d’analyses bio-informatiques
• Expérience dans les analyses épidémiologiques et phylogéographiques
• Expérience de l’utilisation des outils statistiques
• Maitrise d’un ou plusieurs langage(s) de programmation (Python ou R, Bash) et d’outil(s) gestionnaire(s) de flux (Nextflow)
• Maitrise des outils de données de séquençage de génome complet de bactéries (traitement des données brutes « short-reads » et « long-reads », annotation, typage MLST, détection de gènes de virulence et résistance, phylogénie)
• Connaissances pratiques et théoriques indispensables sur les staphylocoques
• Expérience de la norme ISO 15189
• Connaissance en biostatistiques
• Capacité à discuter avec différents professionnels (biologistes, TLBM, secrétaires, bio-informaticien, support technique fournisseurs)
• Connaissance de l’anglais technique et scientifique (niveau B2/C1) ; capacité de rédiger des articles scientifiques
• Connaissances des règles d’hygiène et de sécurité au travail

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