Proposition de doctorat d’université – Reims Champagne – Ardenne

La perte de la porine OprD, qui est le canal d’entrée des carbapénèmes, entraîne la résistance de Pseudomonas aeruginosa à cette classe d’antibiotiques. Nous avons montré que la perte d’OprD s’accompagnait d’une virulence accrue de P. aeruginosa vis-à-vis de l’épithélium des voies respiratoires humaines. L’objectif de ce travail est de définir le mécanisme expliquant pourquoi l’absence de la porine OprD s’accompagne d’une augmentation de pathogénicité afin de trouver de nouvelles pistes thérapeutiques. Pour cela, nous utiliserons, d’une part, une approche génomique de type Tn-Seq pour déterminer les gènes essentiels de P. aeruginosa OprD mutant lors de l’infection de l’épithélium des voies respiratoires humaines, et d’autre part, une approche phénomique de type phénotypage à haut-débit pour établir les voies métaboliques en lien avec les génotypes identifiés. Ces techniques seront utilisées sur des modèles ex vivo d’épithéliums des voies aériennes humaine cultivés en interface air-liquide et in vivo de pneumonie aiguë chez la souris.