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Analyse de vos réponses

Bio-Informatique et Microbiologie médicale

Chères et chers collègues,

La SFM vous propose de participer à une courte enquête portant sur les besoins et les ressources en bio-informatique des laboratoires de microbiologie médicale. L’objectif de ce questionnaire est d’établir un état des lieux, de favoriser la collaboration inter-laboratoire et d’explorer des pistes d’amélioration concrètes.
Le questionnaire comprend 9 questions et peut être complété en seulement 5 minutes
Date limite de réponse :  19/11/2023 –  Questionnaire cloturé
A la suite de vos réponses, nous ferons un retour des résultats obtenus qui sera diffusé auprès de la communauté. Nous vous remercions par avance vivement de votre participation.

 

Vos réponses

Merci beaucoup pour votre réponse au questionnaire de la SFM sur la Bio-Informatique en Microbiologie, voici une première analyse descriptive des réponses reçues :

Caractéristiques générales des répondants

Caractéristique Total, N = 144 Bacteriologie, N = 58 Mixte, N = 54 Parasito-Mycologie, N = 6 Virologie, N = 26 p-valeur1
Analyses_Bio_Info, n (%) <0.001
    Non 52 (36) 16 (28) 30 (56) 3 (50) 3 (12)
    Oui 92 (64) 42 (72) 24 (44) 3 (50) 23 (88)
Realisation_sur_place, n (%) 0.65
    Non 15 (16) 8 (20) 5 (21) 0 (0) 2 (8.7)
    Oui 76 (84) 33 (80) 19 (79) 3 (100) 21 (91)
    Manquant 53 17 30 3 3
Bio.info_dans_equipe, n (%) 0.27
    Non 98 (68) 34 (59) 40 (74) 5 (83) 19 (73)
    Oui 46 (32) 24 (41) 14 (26) 1 (17) 7 (27)
Bio_info_temps_plein, n (%) 0.56
    Non 14 (31) 8 (33) 3 (23) 1 (100) 2 (29)
    Oui 31 (69) 16 (67) 10 (77) 0 (0) 5 (71)
    Manquant 99 34 41 5 19
Interet_Webinars, n (%) 0.082
    Non 22 (15) 8 (14) 13 (24) 0 (0) 1 (3.8)
    Oui 122 (85) 50 (86) 41 (76) 6 (100) 25 (96)
Ressource_IT, n (%) 0.74
    Non 95 (66) 39 (67) 37 (69) 3 (50) 16 (62)
    Oui 49 (34) 19 (33) 17 (31) 3 (50) 10 (38)
Cluster_Analyse, n (%) 0.64
    Non 95 (66) 36 (62) 39 (72) 4 (67) 16 (62)
    Oui 49 (34) 22 (38) 15 (28) 2 (33) 10 (38)
Stockage_Institut, n (%) 0.007
    Non 60 (42) 22 (38) 31 (57) 2 (33) 5 (19)
    Oui 84 (58) 36 (62) 23 (43) 4 (67) 21 (81)
Outil_Partage_Code, n (%) 0.35
    Non 127 (88) 51 (88) 49 (91) 4 (67) 23 (88)
    Oui 17 (12) 7 (12) 5 (9.3) 2 (33) 3 (12)
Interet_GitHub_microbiologie, n (%) 0.014
    Non 35 (24) 13 (22) 20 (37) 0 (0) 2 (7.7)
    Oui 109 (76) 45 (78) 34 (63) 6 (100) 24 (92)
Structure, n (%) <0.001
    autre 33 (23) 15 (26) 15 (28) 1 (17) 2 (7.7)
    CH 29 (20) 3 (5.2) 26 (48) 0 (0) 0 (0)
    CHU 82 (57) 40 (69) 13 (24) 5 (83) 24 (92)
1 test exact de Fisher

Distribution par Discipline et Structure

Localisation des participants

QUESTION 1 : Utilisez vous des analyses bio-informatiques dans votre laboratoire?

Caractéristique N = 144
Analyses_Bio_Info, n (%)
Non 52 (36)
Oui 92 (64)

Dans quel contexte?

Pour quelles applications?

QUESTION 2 : Avez-vous un(e) ou plusieurs bio-informaticien(ne)(s) dans votre équipe?

Nombre d’ETP Bio-Info par équipe

mediane [range] =1[0.2-5]

Niveau de diplôme des Bio-Informaticiens

Financement des Bio-Informaticiens

QUESTION 3 : Avez-vous des ressources IT (administrateur système/réseau/sécurité) en support à la bio-informatique ?

Caractéristique N = 144
Ressource_IT, n (%)
Non 95 (66)
Oui 49 (34)

QUESTION 4 : Votre laboratoire a-t-il accès à un cluster d’analyse?

Caractéristique N = 144
Cluster_Analyse, n (%)
Non 95 (66)
Oui 49 (34)

QUESTION 5 : Votre laboratoire a-t-il accès à un stockage institutionnel?

Caractéristique N = 144
Stockage_Institut, n (%)
Non 60 (42)
Oui 84 (58)

QUESTION 6 : Utilisez-vous un outil de partage de code tel que GitHub pour partager vos codes et données ?

Caractéristique N = 144
Outil_Partage_Code, n (%)
Non 127 (88)
Oui 17 (12)

QUESTION 7 : Seriez-vous intéressé(e) par la mise en place d’un GitHub/autre outil de partage pour la Microbiologie hospitalière française ?

Caractéristique N = 144
Interet_GitHub_microbiologie, n (%)
Non 35 (24)
Oui 109 (76)

Quelles seraient vos attentes pour ce partage ? (plusieurs
réponses possibles)

QUESTION 8 : Seriez-vous interessé(e) par des webinaires mixtes cours/TP d’analyses bio-informatiques en Microbiologie?

Caractéristique N = 144
Interet_Webinars, n (%)
Non 22 (15)
Oui 122 (85)

Par quel(s) thème(s) seriez-vous potentiellement intéressé(e)?
(plusieurs réponses possibles)